Advertência por bater o ponto corretamente?

Minha esposa ganhou uma advertência por alguns dias ter batido seu ponto no horário correto (o horário que saiu) e não o horário que a empresa estipulou. A empresa diz que não paga hora extra, porem ela exige que seus funcionários saem apenas quando acabar o serviço, fazendo 20 a 30 min de hora extra todos os dias alem de fazer reuniões periódicas fora do horário de trapalho, porem eles "instruem" os funcionários a baterem o ponto no horário correto de trabalho. Minha esposa assinou a devida pois precisamos do emprego, como prosseguir?