Cheque sem fundos apresentado fora do prazo e com prazo expirado

Dei um Cheque Caução para uma locação de temporada de uma Casa para um projeto cultural.

Após o uso, o proprietário alegou danos no imóvel. Aceitei pagar em parte os danos, porém, houve desacordo, pois não pude mais acessar o local para fazer meu orçamento dos reparos (com profissionais de minha parte).

Assim, o proprietário depositou o Cheque de R$5.000,00 para cobrar os danos, que pelo orçamento dele, era de aproximadamente R$1.500,00 (e mesmo sem fazer uma vistoria formal após a locação).

O Cheque foi dado na data da locação da casa (de mesma praça), no início de outubro/15, e depositado em desacordo com mais de 60 dias - em janeiro/16. Daí, o cheque estava sem fundos, pois a conta do Projeto já havia sido zerada para apresentação de contas.

Já se passou dois anos do fato (depósitos do cheque sem fundos), o prazo prescricional já expirou, e nenhuma outra atitude formal foi tomada por parte do proprietário, porém, meu nome continua sujo e com restrição de crédito - o que descobri ao tentar financiar minha casa...

Como posso exigir a baixa do meu nome? Ou a devolução do cheque? Ou qual a atitude correta a ser tomada para a resolução deste caso?

Obs: Dias após deixarmos o local, sem fazer uma vistoria formal após nossa locação, o imóvel residencial foi locado para outro inquilino, que se mudou para lá e habita a casa até hoje, e os reparos foram feitos pelo proprietário para a nova locação.